deepvariant:Google的DeepVariant变体调用方作为Nextflow管道 源码

nf-core / deepvariant 深度变体作为Nextflow管道 用于运行Nextflow管道。 什么是DeepVariant,为什么在Nextflow中使用? Google Brain团队于2017年12月发布了基于DeepLearning:DeepVariant的 。 实际上,DeepVariant首先基于BAM文件构建图像,然后使用DeepLearning图像识别方法来获取变体,并最终将预测的输出转换为标准VCF格式。 DeepVariant作为Nextflow管道为用户提供了多个优势。 它通过预处理步骤自动处理一些额外需要的索引和压缩文件的创建,这些文件是Deep