nextflow_rnaseq_training_dataset:nextflow训练rnaseq数据集 源码

nextflow_rnaseq_training_dataset 生成一个小的RNA-Seq训练数据集的步骤。 数据集 数据集从ArrayExpress 下载- 描述 实验设计 标题:对线粒体代谢中不同类型压力的响应在酵母恒定状态下,以芽生酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)用于研究9种不同的压力条件。 姓名 描述 生物 酿酒酵母 RNA测序 使用具有poly-A选择的Illumina TruSeq样品制备试剂盒v2(Illumina,圣地亚哥,加利福尼亚州,美国)制备了用于测序的RNA样品。 根据制造商的说明,将片段聚集在cBot上,并在两端配对(2x100bp)的Illumina HiSeq 2500的两个泳道上测序 实验类型 编码RNA的RNA序列,病例对照设计,剂量React设计,生长条件设计,刺激或应激设计 引文 Lahtvee PJ,Sánche