IsoQuant:基于参考的RNA长读分配和定量 源码

IsoQuant 1.2手册 1.1。 1.2。 2.1。 2.2。 2.3。 3.1。 3.2。 3.3。 快速开始: 可以从下载IsoQuant或通过conda安装: conda create -c conda-forge -c bioconda -n isoquant python=3 isoquant 如果手动安装,则需要安装Python3(3.7或更高版本), , , , 和其他一些常见的Python库。 有关详细信息,请参见requirements.txt 。 您还需要在$PATH变量中包含和 。 要在原始FASTQ / FASTA文件上运行IsoQuant,请使用以下命令 isoquant.py --reference /PATH/TO/reference_genome.fasta --genedb /PATH/TO/gene_annotation.gtf