fastq_to_bam_paired_snakemake:遵循GATK最佳做法的蛇形将配对的fastq文件转换为可分析的bams 源码

fastq_to_bam_paired_snakemake 遵循GATK最佳做法,将成对的fastq文件转换为可分析的bams的snakemake。 该存储库包含运行snakemake所需的所有文件夹。 由于GitHub不允许空文件夹,所以results /和logs / cluster /当前包含占位符文件,但是将此存储库结构复制到服务器后,可以从服务器中删除这些占位符文件。 要运行snakemake,请按照这些文件中的说明更新config / samples.yaml和config / config.yaml,然后按照fastq_to_bam_paired.snakefile中的说明