fastq_download_fr_acc_list 源码

fastq_download_fr_acc_list 这仅适用于配对末端读取。 对于单端,需要修改inner_sra.sh文件。 清理文件夹rm -rf batch / * err / * temp / * down *,然后复制整个父文件夹以进行其他研究。 将特定的acc.txt文件替换到该文件夹​​。 sh batch.sh生成批处理文件。 sh Submit.sh将fastq文件下载到临时文件夹。 下载完成后,清除错误文件。 mv down * err / 如果您要下载的样本很多, 修改submit.sh文件以设置等待时间(秒) 每次提交作业之间的时间间隔,以避免HPC过多。