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颜色分类leetcode DeepCC 一种新的基于深度学习的癌症分子亚型分类框架

上传者: 2024-10-06 03:13:42上传 ZIP文件 17.12MB 热度 3次
颜色分类leetcode深度CC DeepCC:一种新的基于深度学习的癌症分子亚型分类框架()更新添加了对使用keras框架进行深度学习的支持。修改了深度网络架构以获得更好的性能。依赖关系当前版本的DeepCC依赖于keras框架,支持CPU和GPU。请先按照说明安装在R中,并确保keras能够正确运行。安装您可以使用devtools直接从GitHub安装DeepCC。 install.packages("devtools") devtools::install_github("CityUHK-CompBio/DeepCC")或者install.packages("remote") remotes::install_github("CityUHK-CompBio/DeepCC")快速开始作为案例研究,您可以从CRCSC的存储库中获取组织良好的结直肠癌数据。 DeepCC只需要两个输入即可启动。一个包含基因表达谱的数据框(每一行代表一个患者样本,列名应该是基因的Entrez标识符)包含训练标签的字符向量( NA
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