infercnvpy:从scRNA seq数据推断拷贝数变异(CNV)。 与Scanpy完美搭配 源码

infercnvpy:Scanpy插件可从单细胞转录组学数据推断拷贝数变异(CNV) Infercnv是可扩展的python库,用于从单细胞转录组学数据推断出拷贝数变异(CNV)事件。 它受InferCNV的启发,但是与很好,并且可伸缩性更高。 警告: 该软件包仍处于实验阶段。 该结果未经验证,只是它们看起来与InferCNV的结果相似但不相同。 我们很高兴收到反馈,欢迎您提供帮助! 入门 请参考。 特别是 和 。 安装 您需要在系统上安装Python 3.8或更高版本。 如果您没有安装Python,建议您安装 。 安装infercnvpy的方法有几种: 从安装最新版本的infercnvpy: pip install infercnvpy 安装最新的开发版本: pip install git+https://github.com/icbi-lab/infercnvpy.gi