RSoptSC:scRNA seq数据的细胞间通信和谱系推断 源码

RSoptSC 更新 演示SoptSC 阅读的SoptSC文章 SoptSC也可作为一个MATLAB包 安装 install.packages( " devtools " ) library( devtools ) install_github( " mkarikom/RSoptSC " ) 特征 单个单元之间的单元间通信的推断 在统一的数学框架中整合多种分析:聚类,标记基因,伪时间和谱系推断 单元间相似度矩阵构建可改善聚类 基于NMF的标记基因鉴定 预测存在的簇数(通过相似性矩阵的eigengap属性) 伪时间中初始单元的预测 文献资料 提供了RSoptSC的完整详细信息和示例。