MULTI Seq:MULTI Seq样本分类工作流程的R实现 源码

deMULTIplex(克里斯·麦金尼斯编写的代码) deMULTIplex是一个R软件包,其中包含用于我们的使用脂质标记的指数进行单细胞RNA测序样品复用的方法的配套软件:MULTI-seq(有关更多信息,请参阅我们的《自然方法》手稿: ) MULTI-seq在方法上类似于细胞哈希(Stoeckius等人,2018,Genome Biology)和Click-Tags(Gehring等人,2019,NBT),除了我们利用脂质和胆固醇修饰的寡核苷酸来快速和非扰动地标记活细胞和核膜。 如果您想试用MULTI-seq试剂(免费!),请填写和/或向我发送电子邮件(chris.mcginnis@ucsf [edu])。 MULTI-seq可与任何基于液滴微流体的scRNA-seq方法(例如3'和5'10X Genomics,Drop-Seq,In-Drop,Seq-Well等)接口,并且还