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论文研究 分子动力学模拟的优化与并行研究.pdf

上传者: 2020-07-29 09:02:54上传 PDF文件 110.75KB 热度 36次
分析讨论了分子动力学模拟的算法特征和计算特点,对串行程序作了优化,并使之适合于作并行化。对模拟体系使用区域分解的方法,在计算节点间保留了部分重叠区域,采用基于消息传递的MPI设计平台,在可扩展机群上实现了并行化,获得了90%以上的并行效率。
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