Mapmaker遗传图谱构建演示

Mapmaker 的遗传图谱构建流程挺老派的，但胜在稳定。BC1、F2、RI 这些数据都不含糊，连缺失数据都标得挺清楚。你只需要改个后缀名，把.txt换成.raw，就能喂给它吃。

命令行操作为主，说白了有点像 DOS 年代的工作方式——需要点耐心，但也够直接，不拖泥带水。像prepare data、group、map这些常用指令，用起来还蛮顺手的。

连锁的sequence命令一次最多 6 个点，别贪多，不然直接闪退，得分批来。compare默认给你排出 20 个最优序列，定位效率还不错。如果你想固定几个核心标记，anchor可以试试，挺实用。

输出结果是.map文件，图谱内容都在里面了。注意，软件要放在C:\根目录下，不然有些路径识别不到。命令行控或者需要构建小批量遗传图谱的朋友，用这个工具还蛮合适。

想对比看看别的遗传图谱工具？可以看看TAMP/GATK 打包资源，或者参考下SSR 标记图谱构建那一套。

如果你平时喜欢图形化界面，那这个工具不太合口味。但要是你就想找个稳一点、逻辑清晰的连锁方案，Mapmaker 还是个不错的老兵。