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FiberNetwork用于WGCNA分析的Fiber RNA seq数据处理

上传者: 2024-10-31 18:45:54上传 ZIP文件 4.64MB 热度 2次

光纤网络使用Fiber RNA seq数据进行WGCNA分析。#目的这组脚本接收RNA seq表达数据并从数据构建共表达网络。使用这些脚本时,您需要修改几行以使您的自定义代码起作用。这些脚本作为您自己分析的起点,而不是分发就绪的脚本集。每个脚本的简要细节如下:1. Fiber_Norm_RPM.R:接收原始计数数据并输出标准化库以及库大小。2. WGCNA_construct.R:修剪基因集,生成共表达对象并放入一个指定目录。3. WGCNA_analysis.R:执行更高级别的分析,以可视化共表达网络之间的异同。

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