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颜色分类leetcode transformer cnn 用于QSAR/QSPR建模的TransformerCNN

上传者: 2024-10-06 12:46:24上传 ZIP文件 39.57MB 热度 15次
颜色分类leetcode Transformer-CNN该存储库包含我们论文中描述的新Transformer-CNN方法的源代码。首先,我们在SMILES规范化任务上训练Transformer模型,例如,给定任意SMILES,模型将其转换为规范化的。其次,我们使用Transformer的内部表示(具有形状(BATCH、LENGTH、EMBEDDING)的编码堆栈的输出)作为SMILES嵌入,并在它们的基础上构建CharNN模型(如DeepChem中所做的卷积和HighWay)。生成的模型适用于分类和回归设置。 “独立”文件夹提供了Transformer-CNN模型的实现,用于在没有TensorFlow的情况下进行预测(仅依赖于NumPy和RDKit)。溶解度和AMES模型可用。用于推断模型在特定预测背后的推理。依赖关系该代码已在Ubuntu 18.04中使用以下组件进行测试: python v.3.4.6或更高版本TensorFlow v1.12 rdkit v.2018.09.2用于互变异构体枚举的molvs
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