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采用子空间对齐算法的细胞类型预测研究

上传者: 2023-06-09 01:09:56上传 PDF文件 4.82MB 热度 3次

本文使用子空间对齐算法,对单细胞转录测序数据进行细胞预测和批次效应校正。通过对齐源域和目标域的子空间,实现数据降维和预测。首先通过主成分分析构建子空间坐标系,然后通过子空间对齐得到目标对齐源坐标系,并将数据投影到对齐后的子空间中,得到数据的低维表示。最后,建立SVM分类器,预测目标域的细胞类型同时进行批次效应校正。

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