cogent3:比较基因组学工具包3 源码

cogent3 cogent3是用于分析基因组序列数据的成熟python库。 我们努力在Jupyter笔记本电脑中提供一流的体验,但是这些算法还支持在具有1000个处理器的计算系统上并行执行。 是给谁用的? 任何想要使用健壮的统计模型分析序列差异的人 cogent3的独特之处在于,它提供了许多用于建模序列进化的,。 cogent3还包括大量时间可逆模型(再次包括)。 我们不仅发明了这些新方法,还为它们的实现及其的。 另外,存在着重于统计估计的新颖的信号处理方法。 任何想要进行探索性基因组数据分析的人 除了我们新颖的方法外, cogent3还提供了一套广泛的功能来处理和分析序列数据。 您可以通过它们的注释来操纵序列,例如 此外,您可以阅读标准的表格和生物学数据格式,使用任何cogent3替换模型执行多序列比对,系统发育重建和树操作,表格数据操作,系统发育可视化等等。 任何寻求功能编程风