genomisc:其他基因组学工具和数据结构 源码

基因组 Golang中的其他基因组学工具和数据结构 HWE go get github.com/carbocation/genomisc/hwe HWE计算Exact或Approximate Hardy-Weinberg P值。 Fast计算近似的P值,然后如果根据您的阈值有意义,则计算确定的Exact P值。 这是采用朴素算法的纯Go实施,因此可能很慢。 它使用big.Int并可以处理非常大的样本量(数十万)。 RAMCSV go get github.com/carbocation/genomisc/ramcsv RAMCSV使用文件句柄和csv.Reader(仅用于提供csv解析设置),并且使您可以通过CSV文件来回搜索文件中的任何行,而不必实际将整个文件保留在内存中。 PRSParser go get github.com/carbocation/genomisc/prs