qsiprep:扩散MRI的预处理和重建 源码

QSIprep:q空间图像的预处理和分析 完整文档位于 关于 qsiprep配置用于处理扩散加权MRI(dMRI)数据的管道。 该软件的主要功能是 BIDS-app方法可预处理几乎所有类型的现代扩散MRI数据。 自动生成的预处理管道可对扫描进行正确分组,畸变校正,运动校正,降噪,共配准和重新采样,从而生成可视报告和质量控制指标。 一种用于运行最先进的重构管道的系统,该系统包括 , , 等算法。 一种适用于DSI和随机q空间采样方案的新颖运动校正算法 前处理 预处理管道是基于可用的BIDS输入构建的,以确保正确处理场图。 预处理工作流执行头部运动校正,磁化率失真校正,MP-PCA去噪,对T1w图像的配准,使用空间归一化和组织分割。 重建 可以在许多其他软件包中重构管道的输出。 我们在qsiprep中提供了一组精选的:ref:`recon_workflows` ,它们可以运行ODF