supergsl:基因组规范语言(GSL)的python实现 源码

超级GSL SuperGSL是用于基因工程的基因组规范语言(GSL)的python实现。 SuperGSL非常具有alpha特性,因此,依靠它做任何事情可能都不是一个好主意。 SuperGSL的灵感来自于Erin Wilson,Darren Platt和Amyris的许多其他人编写的原始基因组规范语言(参见:和)。 SuperGSL的新功能 查看SuperGSL与原始gsl有何不同 安装SuperGSL 可以使用python软件包管理器安装SuperGSL。 pip install supergsl 这会将两个命令添加到您的环境中sgsl和sgsl-util 。 这两个命令可用于分别调用编译器命令和实用程序命令。 使用Docker安装和运行SuperGSL SuperGSL带有Dockerfile和docker-compose文件,因此您可以运行superGSL而不会污染本地环境