GenomicSQLite:SQLite的基因组扩展 源码

SQLite的基因组扩展 (“ GenomicSQLite”) 这个为嵌入式RDBMS添加了功能,从而支持基因组生物信息学中的应用程序: 重叠查询和连接的基因组范围索引 in-SQL实用程序功能,例如反向互补DNA,解析“ chr1:2,345-6,789” 自动流存储压缩(也可) 直接从HTTP(S)URL读取(也可) 预先调整的“大数据”设置 2020年10月的这张海报讨论了背景和长期雄心壮志: 我们的演示了Python(几种语言绑定之一)的关键功能。 自行承担风险:该扩展对数据库存储层进行了根本性的更改。 虽然旨在维护ACID交易安全性,但它还很年轻,并且几乎没有零错误。