dce:寻找生物途径中的因果关系 源码

dce 计算对(生物)网络的不同因果影响。 安装 从Bioconductor安装最新的稳定版本: BiocManager :: install( " dce " ) 从GitHub安装最新的开发版本: remotes :: install_github( " cbg-ethz/dce " ) 项目结构 . :R包 inst/scripts/ :Snakemake工作流程,用于出版物中的所有调查 crispr_benchmark :实际数据验证 ovarian_cancer :卵巢癌如何失调通路? synthetic_benchmark :综合数据验证 tcga_pipeline :计算来自TCGA的数据加载的效果 发展须知 在本地检查包裹: Rscript -e "lintr::lint_package()" Rscript -e "devtools::test()" Rs