RNASeq分析工具包 源码

RNASeq-analysis-toolkit测试版 该存储库包含(希望)一个易于使用的工具来分析RNASeq数据。 依存关系 bowtie2 HTSeq R包 DESeq2 皮尔 dplyr 分割形状 ggplot2 RColorBrewer 增强火山 该工具假定所有预处理步骤均已执行。 这包括: 质量控制 可以使用诸如fastqc 工具评估序列质量 此后,可以使用例如trimmomatic 或cutadapt 评估搁浅 我以前使用过的脚本可以在这里找到: ://rseqc.sourceforge.net/#infer-experiment-py 使用诸如领结构建