pgge:泛基因组图评估器 源码

ge 泛基因组图评估器 该全基因组图评估管道测量全基因组图(在变异图模型中)的重建精度。 其目的是为找到针对给定输入数据和任务的最佳全景基因组图构建工具提供指导。 它分为五个阶段: SplitSamples :(样品制备)-简短说明。 去做。 :(分割序列)-简短说明。 去做。 SubSampling :(选择随机序列的子集)-简短说明。 去做。 :(对齐)-简短说明。 去做。 :(比对评估)-简短说明。 去做。 :(绘图评估结果)-简短说明。 去做。 一般用法 克隆此存储库: git clone --recursive https://github.com/pangenome/pgge cd pgge 使用pggb创建一个pangenome图及其共识图,并将结果存储在pggb_yeast目录中。 :warning: 此步骤假定您已正确安装了pggb : pggb -i da