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minimap2:适用于基因组和剪接核苷酸序列的通用成对比对器 源码

上传者: 2021-04-08 22:05:18上传 ZIP文件 252.84KB 热度 8次
入门 git clone https://github.com/lh3/minimap2 cd minimap2 && make # long sequences against a reference genome ./minimap2 -a test/MT-human.fa test/MT-orang.fa > test.sam # create an index first and then map ./minimap2 -x map-ont -d MT-human-ont.mmi test/MT-human.fa ./minimap2 -a MT-human-ont.mmi test/MT-orang.fa > test.sam # use presets (no test data) ./minimap2 -ax map-pb ref.fa pacbio.fq.gz > aln.
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