motif mark:盒式外显子基序可视化 源码

母题 该脚本可将来自fasta文件的基因片段上的基序可视化。 概括 在被翻译成蛋白质之前,mRNA经历了剪接过程,以去除内含子并将外显子粘贴在一起。 通常,mRNA可以被剪接,产生可能对某种细胞类型或功能具有特异性的同工型。 选择性剪接可通过某些基序或短序列的存在来介导,其中调节剪接的蛋白结合或定位。 该脚本的目的是快速可视化基因片段和基序的位置。 输入 包含内含子为小写而外显子为大写的基因的fasta文件 txt文件,每行包含一个主题,支持IUPAC歧义编码,不区分大小写 输出 SVG文件以fasta文件的前缀命名 黑色细线代表的内含子 外显子是黑色矩形 图案是彩色的并由图例表示