briscoe nf tobias:Tobias分析工具的Nextflow包装器 源码

布里斯科-nf-托比亚斯 Joaquinas的分析管道与Tobias分析工具一起使用 管道轮廓 管道运行的不同步骤。有关每个步骤的详细说明,请访问其 。 给定一个设计文件,一个主题文件和映射文件(bam格式),它将在所有条件下运行TOBIAS的ATACorrect,ScoreBigwig,BINDetect,并且将为文件中的每个主题生成经过校正插入的PlotAggregate元图。 用法 可以在以下示例中运行管道: nextflow run luslab/briscoe-nf-tobias \ -r master \ -profile crick \ --genome genome.fa \ --regions regions.bed \ --peaks regions.bed \ --blacklist blacklist.bed \ --motifs mo