MultiModalMuSig.jl:一个Julia包用于使用主题模型提取突变特征 源码

多重模态 一个Julia包,实现了几个用于突变签名估计的主题模型。 多模式相关主题模型(MMCTM)采用矩阵矩阵的数组,其中每个矩阵的第一列是突变类型索引,第二列是特定样本的突变计数。 以下示例说明如何使用MMCTM对SNV和SV计数执行推理: using MultiModalMuSig using CSV using DataFrames using VegaLite using Random Random . seed! ( 42 ) snv_counts = CSV . read ( " data/brca-eu_snv_counts.tsv " , delim = ' \t '