genome file handler 源码

基因组文件处理程序 笔记 该项目被编码为我的论文项目的子项目。 它用作加载和写入参考基因组数据(* .fa / *。fna),读取数据(* .sam)和变异数据(* .vcf)的工具API。 加载后,所有数据都应该更容易且更清晰地访问。 (尚未添加有关处理数据的功能,因为我的项目中不需要这些功能。) 参考基因组数据(* .fa / *。fna / *。fasta文件) 格式规格 该格式与人类参考基因组的正式发布有关。 (版本:GRCh38) 尽管没有找到详细的格式手册,但我尝试识别格式规范并使之可读和可编程。 因此,我在该项目中使用的规范示例如下: >ch1 LN:151 AS:GRCh38 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA