CRISPRi_Screening_AceticAcid:CRISPRi菌株文库的表型筛选[Smith等2017Mol Syst Biol(2017)13 源码

CRISPRi_筛选_醋酸 CRISPRi菌株文库的表型筛选乙酸耐受性 目的 我们筛选了一个CRISPR干扰文库,该文库由9000多种酿酒酵母菌株组成,其中所有必需和呼吸生长必需基因中的98%以上都被多个gRNA靶向。 创建该存储库的目的是为任何用户提供从原始数据开始重现整个分析的机会。 内容 该项目中描述的代码显示了如何(a)准备,(b)分析和(c)可视化此研究中生成的高通量表态学数据。 在该项目中,我们使用了两个高通量表象学平台 Scan-o-matic 先进行生物筛选微培养,然后进行PRECOG分析 这项研究中生成的所有原始数据都位于文件夹** RAW_DATA **中。 它具有以下子文件夹 SOM_AA_TITRA:扫描型乙酸滴定原始数据(板7和8) SOM_ATC_TITRA:扫描O-自动ATc(无水四环素)滴定原始数据(板7和8) SOM_SCR_R001:第1轮扫描