长散布的核元素(LINEs)中的逆转录酶片段的鉴定和表征。
从异质性,系统发育和染色体分布方面分析了桑树基因组中LINE逆转座子的逆转录酶(rt)片段。 我们使用简并引物对扩增并鉴定了rt的保守域。 序列分析表明rt片段高度异质且富含A / T碱基。 序列同一性为31.8%至99.4%。 基于序列相似性,将rt片段分为八组。 此外,在同一组克隆中,相似的终止密码子分布模式表明它们经历了相似的进化过程。 有趣的是,对从桑树和其他13种植物中分离的rt片段的系统发育分析表明,两个远缘相关的类群(桑树和Pa药Paeonia suffruticosa)组合在一起。 似乎这种现象不是由水平转座因子转移引起的。 荧光原位杂交分析表明,大多数rt片段集中在桑树染色体
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