分子动力学分析软件namd2.7
NAMD(NAnoscaleMolecularDynamics)是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码。NAMD用经验力场,如Amber,CHARMM和Dreiding,通过数值求解运动方程计算原子轨迹。[1] 1.软件所能模拟的体系的尺度,如微观,介观或跨尺度等 微观。 是众多md软件中并行处理最好的,可以支持几千个cpu运算。在单机上速度也很快。 模拟体系常为为10,000-1,000,000个原子。 2.软件所属的类型,如MD,DPD,DFT,MC,量化,或交叉等 全原子md,有文献上也用它做过cgmd。 3.软件能研究的相关领域,使用者的背景最好是? 使用的力场有charmm,x
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