.raw图像带分割切片提取
分割.raw 图像的带数据切片提取功能,挺适合搞医学图像的朋友用来做预。它能一口气扫完整个图像,把那些有分割内容的切片都挑出来,叠成一个三维矩阵,方便你去提 patch、训练模型啥的。写得还挺简洁,核心逻辑也清楚,路径传进去就能跑,不整花活。
提取逻辑比较干脆:给函数一个.raw
图像路径,它就自动遍历每个切片,判断里面有没有分割数据,有的话就留着,没的直接跳过。输出file_data
和data_slice_number
,一个是三维矩阵,一个是切片数量。
适合那种带有 mask 标注的三维图,像 CT、MRI 那种都挺合适。要是你后面还想按块提 patch、做分类啥的,就可以用作者提到的patch 提取代码。
顺带推荐几个关联资源,像是matlab 导入.raw 图像、基于 VTK 的三维切片,还有Otsu
分割、三维重建啥的,配合用效果更好。
哦对了,记得.raw
文件得是三维结构的,不是那种普通图,才得出来。有兴趣的可以去作者 CSDN 翻翻,别的工具也还蛮多。
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