GenomicsFeatures基因组特征矩阵分析应用
该项目包含一个用Python编写的Google App Engine应用程序,该应用程序执行以下任务:
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将tsv格式的n x m特征矩阵转换为csv格式的文件,其中包含n x m行元组(特征、样本、值) - run_fmx_convert.py
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在Datastore中为此数据构建模型 - model.py
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运行一个仅限地图的MapReduce作业,将您从GCS转换的csv文件导入模型 - pipeline.py
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也可以通过bulkload机制导入数据,但速度较慢 - run_upload_data.sh
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在特征名称上定义和构建全文搜索索引 - search.py
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提供允许您执行以下操作的用户界面 - main.py
使用全文搜索查找特征,完成管理任务。
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