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GenomicsFeatures基因组特征矩阵分析应用

上传者: 2024-12-22 12:33:17上传 ZIP文件 403.33KB 热度 2次

该项目包含一个用Python编写的Google App Engine应用程序,该应用程序执行以下任务:

  1. 将tsv格式的n x m特征矩阵转换为csv格式的文件,其中包含n x m行元组(特征样本) - run_fmx_convert.py

  2. 在Datastore中为此数据构建模型 - model.py

  3. 运行一个仅限地图的MapReduce作业,将您从GCS转换的csv文件导入模型 - pipeline.py

  4. 也可以通过bulkload机制导入数据,但速度较慢 - run_upload_data.sh

  5. 特征名称上定义和构建全文搜索索引 - search.py

  6. 提供允许您执行以下操作的用户界面 - main.py

使用全文搜索查找特征,完成管理任务。

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