NPG Docker基于Docker的多管道原型项目

npg_docker最后更新：28/10/14 (sd15)。该存储库汇集了Stefan Dang在Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton的安置项目中的各类原型。此项目历时3个月，探索将不同的对齐程序或管道打包到容器中，用于封闭环境中的生产，或作为Illumina BaseSpace Native Apps使用。更多细节和插图请参阅Sanger Informatics Group Meeting的演讲。概述如下：autobuild：该脚本自动构建所需的所有管道二进制文件，管理于相同的基础映像上却在单独的Docker容器内运行。与在单个容器中构建所有二进制文件相比，这大幅减少了构建时间和维护成本，同时保留了虚拟化的优势（例如可预测的环境和数据来源）。 basespace-smalt：用于在单个容器中部署。