Improvement of ProteinInference蛋白质推理项目的优化指南

Improvement_of_ProteinInference项目运行步骤如下：

1. 打开项目：

• 使用Netbeans IDE打开项目源代码并进行构建。

2. 运行测试：

• 输入：项目输入文件位于sigmaTestData文件夹内，包含测试数据的文件“test_peptide_44_proteins.txt”。

• 文件内容格式为：实际蛋白质和测试肽信息。

3. 查看输出：

• 输出：生成的测试结果文件位于sigmaTestResult文件夹内，文件名为“test_peptide_44_proteins_derived_with_contraint.txt”。

• 输出格式包括：迭代号、Epsilon、AvgTP、AvgFN、AvgPrecision、AvgRecall、AvgFmeans等数据。

项目文件说明：

• 源代码文件夹中包含主要代码文件及相关依赖文件。

• magpi_database_map.txt： 该文件是代码运行的重要依赖项，用于数据库映射。

请严格按照以上步骤操作以确保数据处理及结果生成的准确性。