nga程序员刷题 crisporWebsite crispor.org网站的所有源代码
nga程序员刷题CRISPOR - CRISPR/Cas9助手CRISPOR预测基因组中的脱靶、排列指南、突出显示有问题的指南、设计引物并帮助克隆。试试CRISPOR使用BWA、来自UCSC基因组浏览器的一些工具(twoBitToFa、bedClip)、各种R包以及大量来自已发表文章的外部包和源代码文件,请参阅文件crisporEffScores.py以获取确切参考或工具提示当您将鼠标悬停在交互式网站或用户手册上的乐谱上时。如果您需要分析一个库的数十万个指南,FlashFry工具可能是更适合您的工具,请参阅。话虽如此,CRISPOR现在有.bed输入,所以只要你不是在数千个外显子上运行,它对于大多数应用程序来说可能已经足够快了。如果您只需要效率分数而没有交互式网站,请尝试“pythoncrisporEffScores.py”,它是一个python模块,但也有一个命令行界面,对于程序员来说可能已经足够了。安装CRISPOR网站镜像或作为命令行工具在本节中,我假设您是root并且想要设置本地CRISPOR网站。如果您只想使用命令行
下载地址
用户评论