JAST Java组装和脚手架工具

JAST Java组装和脚手架工具JAST（Java Assembling and Scaffolding Tool）是一个从成对的Illumina文件执行组装和脚手架的程序。它使用以下软件：弹性条A5领结天鹅绒优化器空间请参阅他们的许可协议以获取更多详细信息，并在使用JAST之前检查它们都已安装在您的计算机上。 JAST的主要目的是让它管理几个软件之间的中间步骤。 JAST需要所有步骤的配置文件（A5管道除外）。这些文件包含您要用于上述软件的选项。每个选项必须由换行符分隔，您可以在上找到示例。一些选项被禁止，因为它们已经被JAST使用（有关更多信息，请参阅帮助选项）。要了解如何使用JAST，请使用“-h”或“--help”选项。例如：java -jar jast.jar -h外部库JAST使用2014年6月下载的JSA