creepy jerk 将连续性状进化建模为Lévy过程的系统发育方法

你好有兴趣将系统发育的连续性状进化建模为Lévy过程吗？此git存储库包含我们在系统生物学中描述的方法的最新源代码，可在找到。我们整理了本指南以回答迄今为止收到的问题。欢迎向我们发送有关方法或模型的问题的电子邮件：mlandis (at) berkeley (dot) edu。我们最好的，迈克尔、乔希和梅森更新2013年7月2日方法现在生成与TreeFig兼容的.jump_snr.txt输出文件，以显示哪些分支具有强烈的跳跃信号（在论文中描述）。 SNR现在通过分支长度的平方根反比来缩放，而不仅仅是分支长度。改进了跳跃正常(modelType=3)性能。安装从命令行，导航到src文件夹。在编译之前，请确认您已安装GNU科学库(GSL)。对于Mac OS X，您可以使用安装GSL发现需要以下命令：g++