nanopolish:MinION数据的信号级算法 源码
纳米抛光 用于牛津纳米Kong测序数据信号水平分析的软件包。 Nanopolish可以计算出拟议的基因组装配的改进的共有序列,检测碱基修饰,相对于参考基因组以及更多信息调用SNP和插入缺失(请参见下面的Nanopolish模块)。 发行说明 0.13.2:修复了加载信号数据时的内存泄漏 0.13.1:修复了某些条形码运行的nanopolish index性能问题 0.13.0:修改HMM转换以允许根据模式(共识与参考变体)更改插入和删除之间的平衡 0.12.5:使SupportFractionByStrand计算与SupportFraction一致 0.12.4:将SupportFractionByStrand和SOR添加到VCF 0.12.3:修复hdf5文件句柄泄漏 0.12.2:将RefContext信息添加到nanopolish variants VCF输出中 0.12.1:改
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