EffectorP 3.0:真菌和卵菌细胞中质外体和细胞质效应子的预测 源码

EffectorP-3.0:真菌和卵菌细胞中质外和细胞质效应子的预测 什么是EffectorP 3.0? 许多真菌和卵菌纲物种正在破坏植物病原体并分泌效应蛋白以促进植物感染。 真菌和卵菌病原体具有多种感染策略,其效应子不具有序列同源性。 但是,效应子仍然具有统一的特性:它们要么位于细胞外,到植物的质外体,要么位于细胞内,到植物的细胞质。 EffectorP 3.0利用这一生物信号,并分别使用了两个分别在质外体和细胞质效应子上训练的机器学习模型。 对于给定的一组分泌的病原体蛋白质,EffectorP 3.0将预测蛋白质是否为: 质外生效应子 细胞质效应子 双重定位的质外体/细胞质效应子 非执行者 什么是EffectorP 3.0? EffectorP不是用于分泌组预测的工具,也不是用于细菌效应预测的工具。 已经对EffectorP进行了训练,可以在分泌组中找到真菌/卵菌体效应子,因