SOAPdenovo2:大型基因组创新组装者 开源

SOAPdenovo2的下一步是什么:MEGAHIT是SOAPdenovo2的正式继任者MEGAHIT:通过简洁的Bruijn图http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793的超快速单节点解决方案,用于大型和复杂的宏基因组学组装https://github.com/voutcn/megahit GitHub上的最新代码:https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2 SOAPdenovo是一种新颖的短读组装方法,可以为人类大小的基因组构建从头草稿。 该程序是专门为汇编Illumina短读而设计的。 它为建立参考序列和以经济有效的方式对未开发的基因组进行准确的分析创造了新的机会。 SOAPdenovo2是SOAPdenovo的继承者。 如果您想引用SOAPdenovo2,请引用在GigaScience(请参见下面的网站)上发表的论文。