CIMS:交联诱导突变位点分析 开源

该软件包包括用于从HITS-CLIP数据中检测统计上可重现的交联诱导突变位点(CIMS)和交联诱导截短位点(CITS)的脚本。 参考文献:Moore,M. *,Zhang,C. *,Gantman,EC,Mele,A.,Darnell,JC,Darnell,RB2014。使用HITS以单核苷酸分辨率绘制Argonaute和常规RNA结合蛋白相互作用的图谱。 -CLIP和CIMS分析。 Nat Protocols,9:263-293。 Zhang,C。†,Darnell,RB†2011。从HITS-CLIP数据以单核苷酸分辨率绘制体内蛋白质-RNA相互作用图。 纳特生物技术。 29:607-614。