L1 norm Graph:miRNA 疾病关联预测的新型半监督方法 源码

L1-范数图 基于L1-范数图的miRNA-疾病关联预测的半监督新方法 方法说明: 我们提出了一种新型的半监督模型,以通过l_1-范数图预测miRNA-疾病关联。 具体来说,我们根据最新版本的MeSH描述子和HMDD重新计算了miRNA的功能相似性以及疾病的语义相似性。 然后,我们在miRNA空间和疾病空间中迭代更新相似性矩阵和关联矩阵。 来自每个空间的优化关联矩阵被组合在一起作为最终输出。 方法要求: 由于我们的方法是在R中开发的,因此我们要求用户在其操作系统上安装R-3.4.2(或更高版本)。 用户也可以安装R包“ parallel”以在Linux / Unix / MacOS上并行运行我们的脚本。 用法: 要运行我们的方法,只需在R编程环境或其他R IDE工具(例如RStudio)中打开“ run_prediction.R”脚本,然后按“运行”按钮。 另一个选择是使用命令行格式运