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archer:在运行CLIMB工作流程之前对扩增子数据进行预处理 源码

上传者: 2021-05-09 07:23:02上传 ZIP文件 76.62KB 热度 6次
射手 用于分类,珩磨和导出读段的Artic资源 关于 这是一个基本的微服务,用于在运行CLIMB工作流程之前对数据进行预处理。它具有一个gRPC API,该API支持启动/取消/监视示例处理任务,并包括一个用于运行服务器和客户端实现的命令行应用程序(称为archer )。 如果用户希望CLIMB对数据运行,则需要在CLIMB处理数据之前在本地检查数据并将其上传到S3存储桶。这是archer进来的地方。它将: 验证ProcessRequest提供的样本以获取最少的元数据 针对扩增子引物方案的与样品链接的过滤器读数 压缩所有目标读取并上传到S3 报告回来 依存关系 除了列出的外部Go软件包,还需要以下工具和软件包来构建微服务可执行文件和文档: 制作 转到工具链 协议 原协议 原始文件 正在安装 易于安装由处理: make all 该命令将: 编译Go的原始文件 编译gRPC API文档 在G
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