openSEQ:带有管道分析软件的NGS计算发行版 开源

使用XOrg和FluxBox桌面环境进行分叉的Ubuntu 14.04最小安装,可用于基于Web的管道构建和作业提交。 HOWTO:1)将VM网络设置设置为桥接适配器类型。 2)将VM加载到客户端3)从主机:$ ssh -X ubuntu @ 'firefox && butterfly.server.py --unsecure'--- passwd = 616287xx 5)或通过X转发将ssh导入主机,然后键入runme这将在客户端上启动Firefox的X会话,然后将其转发到主人。 第一个主页选项卡链接到我们的管道构造器。 第二个主页选项卡链接到客户端上的xterm会话。 包含的软件(位置-名称):路径-biobambam路径-bwa路径-bowtie2路径-领结路径-袖扣路径-bcftools路径-tophat路径-手术刀路径-samtools路径-sra-toolkit路径-bamtools路径-delly路径-delly-并行路径-picard工具路径-fastahack路径-twoBitToFa〜/ prog / java /-静音〜/ prog / python /-鸭嘴兽