diamond:加速的BLAST兼容的本地序列比对器 源码

介绍 DIAMOND是用于蛋白质和翻译后的DNA搜索的序列比对器,旨在用于大序列数据的高性能分析。 主要功能是: BLAST以100x-10,000x的速度对蛋白质和翻译的DNA进行成对比对。 移码比对,用于长时间阅读分析。 资源需求低,适合在标准台式机或笔记本电脑上运行。 各种输出格式,包括成对的BLAST,表格和XML,以及分类标准。 文献资料 在线文档位于。 支持 Diamond是积极支持和开发的软件。 请使用来查找故障,并使用中的问题,评论,功能请求等。 关于 DIAMOND由本杰明·布赫芬克(Benjamin Buchfink)在德国图宾根马克斯·普朗克发育生物学研究所Drost实验室开发。 [ ] [ ] [ Google学术搜索] [ Drost实验室] [ MPI-EBIO ] 在已发表的研究中使用该工具时,请引用: Buchfink B,路透K,德罗斯