SCDC:SCDC项目最初位于:https:github.commeichendongSCDC。 支持稀疏矩阵等 源码

SCDC:通过多个单细胞RNA测序参考的大容量基因表达反卷积 SCDC是用于批量的方法,它利用了来自多个参考数据集中的细胞类型特异性基因表达。 SCDC采用ENSEMBLE方法来整合来自不同实验室,在不同时间产生的不同scRNA-seq数据集的去卷积结果,从而隐含地解决了混淆问题。 安装 您可以使用以下命令从安装发布的SCDC版本: if ( ! require( " devtools " )) { install.packages( " devtools " ) } devtools :: install_github( " meichendong/SCDC " ) 小插图 请参阅。 SCDC论文发表。 当前存储库的注释 该存储库是的副本。 它包含以下修改: 与稀疏矩阵的兼容性,使用:R中的dgCMatrix对象。 具有并行化的例程 标记选择的动态阈值 日志等方面的改进。