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Minotaor:氨基酸序列注释符 源码

上传者: 2021-05-03 07:16:48上传 ZIP文件 496.04KB 热度 15次
米诺塔尔 Minotaor是一个美浓酸序列阿鲁たT或用于快速识别一个ORF常见蛋白质标签和接头。 另外,它可以标记已知在翻译过程中引起问题的肽基序。 它使用Biopython。 背景 在命名法中,序列基序是对氨基酸(签名,指纹)出现的描述,可以是模式,也可以是轮廓。 模式是使用正则表达式样语法对主题进行的定性描述。 配置文件(或权重矩阵)是特定于位置的氨基酸重量和空位成本的表格。 许多独立的二进制分类可以应用于这些主题:是标签吗? 是链接器? 是抗原决定簇吗? 等等.. 安装 pip install minotaor 用法 import minotaor from Bio . Seq import Seq from Bio . SeqRecord import SeqRecord protein = Seq ( "SYYHHHHHHHDYPTEGKSSGSGSESKST*EDINBURG
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