Mamda:通过歧管对齐方式推断微小RNA 疾病关联。

通过推断miRNA疾病关联发现疾病相关的microRNA(miRNA)对于了解疾病的发病机理以及进行治疗和预防至关重要。 最近开发的用于推断miRNA疾病关联的计算模型假设功能相关的miRNA与表型相似的疾病相关联,因此通过使用miRNA-miRNA和疾病疾病的相似性来推断miRNA疾病的关联,具体取决于开采现有的生物资源来确定。 从流形学习的角度来看,miRNA-miRNA相似性和疾病-疾病相似性分别确定了miRNA和疾病的低维流形,并且当前计算模型的基本假设等同于miRNA和疾病的流形结构之间的一致性。 在本文中,我们提出了一种新颖的微小RNA疾病推断框架(MAMDA),该框架明确利用了这种一致性特性,并通过将miRNA的歧管结构与疾病的排列对齐并通过对经过实验验证的miRNA疾病的监督来推断出miRNA疾病的关联。协会。 基于三个方面,实验结果表明,提出的框架优于几种具有代表性的最新技术。 首先,使用k倍交叉验证的AUC值表明,与四种经典技术(HGIMDA,HDMP,RLSMDA和NCPMDA)相比,我们的方法可获得更可靠的预测。 其次,用HMDD和dbDEMC验证了miRNA与