TraceTuner:DNA测序质量值碱基检出和跟踪处理 开源

Tracetuner是用于从DNA测序仪器中对跟踪文件进行基本和高质量调用的工具。 该代码库最初由Celera业务的Paracel开发,于2006年作为开源发布。Celera使用TraceTuner调用了果蝇和人类基因组测序项目的30+百万条读数。 2000年,Applied Biosystems将TraceTuner与ABI3700 Genome Analyzers捆绑在一起,并将其运送给这些毛细管电泳测序仪的客户。 支持混合碱基调用的TraceTuner的更高版本已被研究社区,私营生物技术部门和美国政府用作不同变异检测,基因分型和法医软件应用程序的组件(例如Applied Biosystems SeqScape,Parcelel Genome Assembler, MTexpert等)。