CellProfiler RunOnCluster:用于在HPC集群上运行的CellProfiler插件 源码

CellProfiler-RunOnCluster CellProfiler模块,用于将批处理作业提交到运行Slurm的集群。 安装 视窗 提供了Swansea中Sunbird群集具有默认设置的预编译可执行文件。 这些可执行文件要求安装Java Runtime Environment。 例如,您可以从获得一个。 源码安装 在Linux上运行或开发自己的插件时,最直接的方法是将插件源复制到Cellprofiler插件目录中。 按照有关安装CellProfiler说明。 在右侧面板上选择您的操作系统。 一旦安装了CellProfiler,请在Cellprofiler首选项中设置plugins目录。 下载然后将文件复制到您的插件目录中。 在plugins目录中,安装插件的其他要求: python2 -m pip install -r requirements.txt 用法 提交到集群 在